Also ich hätte in meinem Fall nichts dagegen, wenn der Arbeitgeber Gleitzeitstunden in Urlaub umwandelt. Für mich ist Urlaubsanspruch grundsätzlich höher zu werten als Anspruch auf Arbeitszeitausgleich und der Arbeitgeber dürfte dann weniger Möglichkeiten haben, mitzureden wenn es darum geht, diesen zu nehmen oder zeitnah abzubauen.
Ich wäre daher vorsichtig, eine vorteilhafte Sache abzulehnen und sich selbst damit zu benachteiligen und als Querulant zu gelten.